Comparison of the Diagnostic Effectiveness of Tuberculosis Microscopy and GeneXpert MTB/RIF with Mycobacterium tuberculosis Cultures from Patients with Suspected Tuberculosis in Chaiyaphum Hospital.

Authors

  • Ubon Sinthupanprathum Medical Technology Department, Chaiyaphum Hospital
  • Warin Hanchana Medical Technology Department, Chaiyaphum Hospital
  • Warunee Sinthuphanprathum Occupational Medicine, Chaiyaphum Hospital

Keywords:

GeneXpert MTB/RIF, AFB Microcropy, TB culture

Abstract

Background: There are several methods for laboratory diagnosis of tuberculosis e.g., AFB microscopy, TB culture, GeneXpert MTB/RIF assay. GeneXpert MTB/RIF assay was recommended by WHO for TB and Rifampicin-resistant TB diagnosis.

Objective: To compare diagnostic effectiveness of AFB microscopy and GeneXpert MTB/RIF with Mycobacterium tuberculosis cultures from patients with suspected tuberculosis in Chaiyaphum Hospital.

Study design: A Cross sectional study, 120 sputum-samples were investigated by all tests (AFB Microscopy, GeneXpert MTB/RIF and TB culture). Cochran’s Q test, Post Hoc test and McNemar Chi-Square test were used for statistical analysis.

Results: Percentage of Sensitivity, Specificity, PPV and NPV were found as follows: 1) GeneXpert MTB/RIF compared with TB culture were 88, 87, 62 and 9, respectively 2) AFB Microscopy compared with TB culture were 33, 100, 100 and 86, respectively 3. AFB Microscopy compared with GeneXpert were 24, 100, 100 and 77, respectively. Diagnostic effectiveness comparison of with GeneXpert MTB/RIF, AFB Microscopy or TB Culture alone by Cochran’s Q test found at least one paired had statistically significant (P-valve < 0.001 there were two pairs of shown the differences; a comparison between AFB Microscopy with TB culture had p-Value = 0.001 and a comparison between GeneXpert MTB/RIF with AFB Microscopy had p-Value <0.001. Whereas a comparison between GeneXpert MTB/RIF with TB culture had P-Value =0.69.

Conclusion: TB culture is superior than AFB Microscopy, GeneXpert MTB/RIF is superior than AFB Microscopy. Whereas, Diagnostic effectiveness of GeneXpert MTB/RIF with TB culture has no statistically significant. Therefore, for clinical practice, we recommend GeneXpert MTB/RIF without AFB Microscopy because GeneXpert MTB/RIF is faster for TB diagnosis and patients isolation in population or risk group that had abnormal chest X-ray results.

References

World Health Oranization. Tuberculosis. 27 October 2022; [Internet]. 2022.[cited 2023 April 03]. Available from: http://www.who.int/news-room/fact-sheets/detail/tuberculosis.

World Health Oranization. Global tuberculosis report 2022. 2022; p6.

กระทรวงสาธารณสุข. แนวทางการควบคุมวัณโรคประเทศไทย พ.ศ.2564. กรุงเทพฯ : กองวัณโรค กรมควบคุมโรค กระทรวงสาธารณสุข. 2565.

เบญจมาศ ภูมิสุขเจริญ. เปรียบเทียบวิธีการตรวจหาเชื้อวัณโรคด้วยวิธีการตรวจ AFB, GeneXpert MTB/RIF และการเพาะเลี้ยงเชื้อวัณโรค. [อินเทอร์เน็ต]. 2564. [เข้าถึงเมื่อ 9 ก.พ.2567]. เข้าถึงได้จาก https://ddc.moph.go.th/uploads/publish/1307020220902071531.pdf .

หัทยา ธัญจรูญ. เทคนิค Xpert MTB/RIF ในการวินิจฉัยกลุ่มผู้ป่วยที่น่าจะเป็นวัณโรคในโรงพยาบาลตากสิน. วารสารเทคนิคการแพทย์ 2562;47(1):6840-58.

สำนักงานป้องกันควบคุมโรคที่ 9 จังหวัดนครราชสีมา. รายงานประจำปี พ.ศ.2564 สถานการณ์โรคที่เฝ้าระวังทางระบาดวิทยา. นคราชสีมา : กลุ่มระบาดวิทยาและตอบโต้ภาวะฉุกเฉินทางสาธารณสุข สำนักงานป้องกันควบคุมโรคที่ 9 จังหวัดนครราชสีมา. 2564.

กระทรวงสาธารณสุข. จับมือ WHO ทบทวนแผนงาน วัณโรคแห่งชาติ มุ่งเป้าลดอัตราป่วยภายในปี 2578. [อินเทอร์เน็ต]. 2565. [เข้าถึงเมื่อ 19 มิ.ย. 2566]. เข้าถึงได้จาก: https://www.thecoverage.info/news/content/3584.

Karuniawati A, Burhan E, Koendhori EB, Sari D, Haryanto B, Nuryastuti T, et al. Performance of Xpert MTB/RIF and sputum microscopy compared to sputum culture for diagnosis of tuberculosis in seven hospitals in Indonesia. Front Med (Lausanne) 2023;9:909198.

Maharjan B, Thapa J, Shah DK, Shrestha B, Avsar K, Suzuki Y, et al. Comparison of Xpert MTB/RIF to Microscopy and Culture for the Diagnosis of Tuberculosis in a Referral Laboratory in Nepal. Jpn J Infect Dis 2021;74(6):517-21.

กระทรวงสาธารณสุข. การตรวจทางห้องปฏิบัติการ ใน แนวทางการสอบสวนและควบคุมวัณโรค (ฉบับปรับปรุง พ.ศ.2566). พิมพ์ครั้งที่ 1. กรุงเทพฯ : กองวัณโรค กรมควบคุมโรค กระทรวงสาธารณสุข. 2566; หน้า 22-25.

Shi J, Dong W, Ma Y, Liang Q, Shang Y, Wang F, et al. GeneXpert MTB/RIF Outperforms Mycobacterial Culture in Detecting Mycobacterium tuberculosis from Salivary Sputum. Biomed Res Int 2018:1514381.

วัชรี จรกา. ความแม่นยําในการตรวจวินิจฉัยวัณโรคดื้อยาด้วย XepertMTB/RIF® assay (GeneXpert MTB/RIF). โรงพยาบาลชลบุรี. [อินเทอร์เน็ต]. 2559. [เข้าถึงเมื่อ 9 ก.พ.2567]. เข้าถึงได้จาก https://www.cbh.moph.go.th/app/intranet/ RIF).pdf.

Reechaipichitkul W, Suleesathira T, Chaimanee P. Comparison of GeneXpert MTB/RIF assay with Conventional AFB Smear for Diagnostic of Pulmonary Tuberculosis in Northeastern Thailand. Southeast Asian J trop Med public health 2017;48(2):313-321.

Maharjan B, Thapa J, Shah DK, Shrestha B, Avsar K, Suzuki Y, et al. Comparison of Xpert MTB/RIF to Microscopy and Culture for the Diagnosis of Tuberculosis in a Referral Laboratory in Nepal. Jpn J Infect Dis 2021;74(6):517-21.

Published

2024-03-13

Issue

Section

Original Article